Los presentes en las membranas son únicos desde el punto de vista químico, a diferencia de los eucariotas y las bacterias, en que los enlaces son los responsables de la unión entre los ác. grasos y , los lípidos de las Archaea poseen enlaces para la unión del glicerol con cadenas laterales hidrofóbicas. En lugar de ac. grasos poseen cadenas laterales formadas por unidades repetitivas de una molécula hidrocarbonada como el .
Los principales tipos de lípidos son los . En algunos éteres las cadenas (fentanil) se unen entre sí por enlaces formando una en lugar de la bicapa característica de las membranas, siendo más y resistentes, siendo habituales por lo tanto en las .