El laboratorio está dotado de mobiliario, materiales e instrumentos adecuados para el aprendizaje de las ciencias naturales. Es un espacio muy amplio y muy bien iluminado dividido en zonas:

• Los semilleros: donde germinan plantas que nos llevaremos a casa o que plantaremos en el huerto

• El cuerpo humano: donde encontraremos láminas, torsos con los órganos internos, esqueletos, modelos de órganos a escala.
  
• La pizarra digital: zona acotada con mesas en forma de U donde se ha instalado la pizarra digital para actividades multimedia e interactivas con conexión a internet.

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• Zona de observación: zona en forma de H delimitada con mesas con conexión eléctrica para poder enchufar aparatos (microscopios, lupas binoculares, juegos eléctricos y aparatos de óptica)

• Zona de experimentación: en forma de U con una mesa central donde el profesor puede realizar experiencias (experimentos) que puedan entrañar algún riesgo (calentadores, algunas mezclas, etc.)

• Los materiales: una larga hilera de armarios y estanterias donde se almacena clasificados todos los materiales de química, óptica, electricimad, magnetismo, geología, biología, etc. Allí se encuentran láminas y posters de todas las disciplinas científicas: biología, anatomía humana, geología, química, física, geografía, etc.

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