El colegio "El Buen Gobernador" participó, entre los años 2000 y 2003, en un primer proyecto europeo Comenius; y  entre los años 2005 y 2008, en un segundo proyecto europeo Comenius,  proyectos educativos incluidos en el Programa Sócrates de la Unión Europea. 

Este tipo de proyectos permitió a los centros procedentes de diferentes países trabajar sobre un tema de interés común. Tuvieron por objeto implicar al mayor número posible de clases, contribuyendo así a estrechar la cooperación entre aulas y disciplinas diferentes. Una de las prioridades consistió en fomentar la participación activa de los alumnos.

En el primer proyecto, llamado "Confabulando" participaron centros de Italia, Grecia y Francia.

El segundo proyecto, denominado "Nuestro pasado, presente y futuro como ciudadanos europeos", se desarrolló con la participación de colegios de Bélgica, Francia y Eslovenia.