Fue en el curso 1992-93 cuando el centro tuvo por primera vez una unidad por cada nivel. Hasta entonces había clases que tenían alumnos de dos cursos. Ese año hubo 2 aulas de infantil y 8 de EGB.

En diciembre de 1996 se traslada el colegio de la calle Escuelas al edificio nuevo situado en la ctra de Valdeláguila: ese año el centro tenía 12 unidades. Al aumentar a 17 unidades el curso siguiente, se tuvieron que trasladar al edificio antiguo los cuatro curso de ESO y parte del 3º ciclo de Primaria.

Aunque en septiembre de 2000 empieza a funcionar el colegio Peñas Albas, nosotros seguimos teniendo 19 unidades ya que todos los alumnos de los Hueros y la ESO de todo el municipio están escolarizados en este centro.

Es septiembre de 2002 cuando nuestro centro se reduce a 13 unidades (3 de infantil, 6 de primaria y 4 de ESO) ya que empieza a funcionar el CEIP Salvador Dalí en los Hueros.

El año siguiente, en septiembre de 2003, empezó a funcionar en los Hueros una sección del IES Atenea, al que están adscritos todos los alumnos de ESO del municipio de Villalbilla y el CEIP Gregorio Canella se quedó con solo 11 unidades. Sin embargo, cada año aumenta el número de aulas del centro, siendo en el curso 2006-2007 de 14 unidades (6 de Ed. Infantil y 8 de Primaria).

Las previsiones de aumento del número de alumnos, y por tanto de unidades, para el próximo curso conllevan la necesidad de nuevos espacios. La edificación actual, creada inicialmente para 9 unidades, no permite más reestructuraciones: se ha cerrado un porche , una terraza, se han unido despachos, construído tabiques... todo ello para habilitar espacios como aulas.
El comedor escolar empezó a funcionar en septiembre de 2003, y este curso casi la cuarta parte del alumnado del centro utiliza dicho servicio.