El IES Gregorio Marañón dispone de27 aulas para grupos con conexión directa a Internet; 8 aulas especiales (música, Dibujo, audiovisuales, Imagen, un aula de Tecnología y 3 de Informática); 4 laboratorios de Biología, Geología, Física y Química y Proyecto Globe; Gimnasio de 260 m2 con acceso inalámbrico a Internete y 4 pistas polideportivas; Biblioteca con acceso inalámbrico a Internet; 15 departamentos didácticos; Secretaría, despachos de Dirección, Jefatura de Estudios y Orientación; Sala de visitas, sala de la Asociación de Madres y padres de Alumnos; Cafetería (con servicio de platos combinados y menú del día) y otras dependencias auxiliares.